Из A в В можно попробовать на самолете. Ну еще лет 5 назад он вроде был и летал. Но Чолпон-ата не то место, которое прямо маст-си. Ну и плавать там не сезон будет)
Билеты можно на самолеты по всем направлениям купить в агенстве. Есть много всяких агенств типа "отдых а средней Азии"